生物工程专业创办于2002年。获批湖南省普通高校一流专业建设点（2020年）和中央财政支持专业建设项目(2011年、2014年)。

生物工程专业是湖南省一流本科专业，依托省级重点实验室与校企合作人才培养示范基地，形成了鲜明的“产教融合、工程导向”特色。专业聚焦发酵与酿造、生物制药两大方向，构建了涵盖基因工程、发酵工程、生物分离工程等核心领域的课程体系。通过实施“校企双导师制”，与湖南省医疗器械产业园、龙牌食品股份有限公司、湖南湘窖酒业有限公司、湖南五洲通药业股份有限公司等共建实习实训基地，强化学生工程实践与创新能力。本专业学生在生物医药、发酵酿造等行业竞争力强，近年考研录取率稳定在30%以上，体现了扎实的学术培养与广阔的职业发展前景。2026年，生物工程专业与湘潭医卫职业技术学院共同实施楚怡工匠计划，新增生物检验设备工程方向，进一步体现了该专业紧跟技术前沿、注重多学科交叉融合以及面向生物医药、绿色制造等产业需求进行工程化设计与创新的培养特色。

培养适应生物技术与工程领域和社会发展需要，德、智、体、美、劳全面发展，具有健全的人格，正确的世界观、人生观、价值观，具备扎实的生物学与工程学基础、掌握生物产品大规模制造的科学原理，熟悉发酵与酿造（或生物制药工程）过程流程与工程设计的基础理论和基本技能，能在生物工程或相关领域从事工程设计、生产管理、产品研发和技术创新等工作的工程技术人才。

现有教师20人，其中教授5人（含湘江学者1人）、副教授或相当职称12人，博士生导师2人、硕士研究生导师16人。

生物化学、工业微生物学、分子生物学、化学工程原理、发酵工程、细胞工程、基因工程、酶工程、生物反应工程、生物分离工程、生物工程工厂设计。

毕业生就业面宽广、遍布全国，深受生物发酵、生物医药、生物农业、生物能源、生物环保和生物服务行业相关企事业单位的欢迎。可在生物制药、生化药物、发酵酿造、保健食品、生物服务等行业或企业从事生产、管理和新产品开发；在科研院所从事科研开发等工作；在生物工程相关的质检、商检、外贸、农业、环保、卫生防疫等部门从事生物检测、技术监控与管理工作。一次性就业率超过国内同类院校平均水平。